超聲波清洗劑的選擇普通能夠從兩個方面思索，一方面要從污物的性質來選擇的清洗劑，另一方面則是要思索清洗劑外表張力、黏度以及高溫后所產生的蒸汽壓的上下。由于這些特性會影響到超聲波空化強弱，高蒸汽壓會降低超聲波空化強度，清洗液體外表的張力大、粘滯度高則不容易產生空化。

因而，張力大和粘滯度高的清洗劑都不利于超聲波清洗。

市面上絕大局部超聲波清洗機槽體采用的是不銹鋼材質沖壓或者焊接而成，不倡議運用強酸強堿易腐蝕槽體的清洗劑，否則將會減短設備運用壽命，有特殊需求可跟廠家溝通改換槽體材質或者鍍防護層。

另外，如需運用易燃易爆的清洗劑，則需求配套降溫防爆工藝。